This newspaper (intern reporter Jiang Qingling) team of Xu Huaqiang, a researcher at the Shanghai Institute of Materia Medica of the Chinese Academy of Sciences, which is further focused on the newly opened source of small molecule ligand function function, systematically reviewed Alphafold3's performance of the alphafold3 in the structure of the Grotein Grotein complex GPCR) and deeply disclosed its limits to药物设计应用。相关研究最近发表在《中国药理学杂志》上。 GPCR是一种重要的靶向药物，其与小分子的接触涵盖了中央研究和药物发育位置。研究小组收集了Alphafold3释放后发表的74个GPCR-SMALL配体复合物分子的实验结构，并比较了H Resulce Alphafold3和实验结构之间的差异。评论的结果表明，Alphafold3在一般受体的骨干预测中表现良好，但仍然很清楚预测结合配体的主要模式的缺点。审查发现，当预测数据库中存在相似的复杂性时，AlphaFold3的性能更好，而预测的预言在面对新化合物或表征不足的结合模式时会显着降低。此外，某些模型具有严重的原子碰撞和非理性的结构特性，其特征是当前算法在能量批准和立体能量和准确性方面存在缺点。对于具有更复杂系统的C型GPCR，AlphaFold3无法完全准确预测蛋白质之间的结合界面。对于小分子，它可以准确预测结合袋，但仍无法预测配体和实际配体的准确位置。就GPCR变构调节器的复杂结构而言，由于数据困难，AlphaFold3在猜测绑定配体的位置方面的精度较差，表明AlphaFold3仍然缺乏处理新颖或未知的变构的结合模式的能力，以及对算法和对算法的支持以及对算法的支持以及对算法的支持以及对算法的支持以及对算法的支持，并支持对算法和支持Algorith和Algorith Algorith和Algrith的支持和支持。研究团队进一步使用AlphaFold3来预测与GPCR结合的拮抗剂结构，并发现通常准确地预测非活性资源。 AlphaFold3在猜测许多受体的狂热调整时表现出良好的表现，并且在拮抗剂依赖时能够成功获得GPCR状态非活动状态的关键特征。研究团队还将Alphafold3与传统分子对接工具进行了比较。结果表明，AlphaFold3可以用作多种摩克在某些情况下，Ular对接分子补充剂，但通常仍然需要验证实验。研究小组建议，将来，可以通过引入物理和化学原理，优化能量评估模块并整合生物学功能信息，从而改善GPCR配体复杂预测中AlphaFold3的性能。相关论文信息：https：//dii.org/10.1038/S41401-025-01617-4